發(fā)布時(shí)間:2021-04-29來源:人民日?qǐng)?bào) 姜曉丹
彭廣敦在做實(shí)驗(yàn)。資料圖片
跨界自學(xué),將編程計(jì)算技術(shù)融入傳統(tǒng)生物學(xué)研究;從頭做起,組建多學(xué)科團(tuán)隊(duì)……在中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院研究員彭廣敦看來,做科研最快樂的地方,就是取得一點(diǎn)進(jìn)步,就很有獲得感。不斷學(xué)習(xí)、不斷嘗試、不斷突破,他一直致力于揭示干細(xì)胞發(fā)育的規(guī)律,期待為醫(yī)學(xué)發(fā)展打開一扇新的窗口。
在中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院的實(shí)驗(yàn)室里,80后研究員彭廣敦穿著一件白大褂,全神貫注地操作著顯微儀器。
顯微儀器下,藍(lán)色試劑浸染過的標(biāo)本,薄薄一片。在彭廣敦的解說中,每一個(gè)細(xì)胞都充滿生命的活力,“細(xì)胞成長(zhǎng)的過程就好比一場(chǎng)音樂會(huì),不同的樂器發(fā)出不同的聲音,從而形成一首美妙的協(xié)奏曲。研究這個(gè)過程,能揭示細(xì)胞發(fā)育的規(guī)律。”
理解具有特定功能細(xì)胞的變化能力與規(guī)律
2009年,彭廣敦從中科院原上海生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所博士畢業(yè),幾年后進(jìn)入中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院,承擔(dān)國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃“干細(xì)胞及轉(zhuǎn)化研究”重點(diǎn)專項(xiàng)、中科院“器官重建與制造”戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)等項(xiàng)目。2017年,廣州再生醫(yī)學(xué)與健康廣東省實(shí)驗(yàn)室成立,彭廣敦加入實(shí)驗(yàn)室細(xì)胞譜系中心,從事干細(xì)胞發(fā)育譜系方面的研究。
干細(xì)胞可以在實(shí)驗(yàn)室里培養(yǎng),不斷增殖,分化為人體中需要的各種功能性細(xì)胞。應(yīng)用這些分化出來的功能細(xì)胞,就有可能實(shí)現(xiàn)再生醫(yī)學(xué)的治療方式。近年來,干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)研究越來越引人關(guān)注。但如何認(rèn)識(shí)并獲得合適的干細(xì)胞,是目前相關(guān)領(lǐng)域的研究瓶頸。
彭廣敦一直想找到胚胎發(fā)育中時(shí)間和空間的編碼規(guī)律。“胚胎發(fā)育就像是建造一座建筑,早期時(shí)段會(huì)繪制一張藍(lán)圖,以后各細(xì)胞成長(zhǎng)的走向都依照藍(lán)圖來進(jìn)行。”他說。
“但用一張圖來解釋胚胎的發(fā)展過程還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠,需要很多張圖,記錄不同時(shí)期的胚胎發(fā)展,形成一部‘動(dòng)畫’。”彭廣敦的研究,就是描繪胚胎發(fā)展的時(shí)間和空間變化圖,從而清晰地追蹤這些細(xì)胞從哪里來,經(jīng)歷了怎樣的過程,又去向哪里。
他介紹,通過獲得這些具有特定功能的細(xì)胞,理解細(xì)胞變化的能力和規(guī)律,從而將其進(jìn)行移植或者再造應(yīng)用,可以為未來的醫(yī)學(xué)發(fā)展打開一扇新的窗口。
進(jìn)行跨學(xué)科研究,新技術(shù)帶來新思路
彭廣敦博士畢業(yè)后,本打算去企業(yè)工作。偶然間,他得到了一個(gè)計(jì)算生物學(xué)研究領(lǐng)域的工作機(jī)會(huì)。然而,對(duì)于沒有編程基礎(chǔ)的彭廣敦來說,這意味著必須邊工作邊自學(xué)。新領(lǐng)域帶來的壓力,反而成了極大的動(dòng)力,讓他看到了從事科研新的可能,也更加堅(jiān)定了他要繼續(xù)走科研之路的決心。
這段跨界經(jīng)歷,為彭廣敦做研究提供了新思路。他發(fā)現(xiàn),將編程計(jì)算技術(shù)融入傳統(tǒng)生物學(xué)研究中,通過測(cè)序并結(jié)合計(jì)算機(jī)對(duì)數(shù)據(jù)信息進(jìn)行挖掘,可以實(shí)現(xiàn)多角度、連續(xù)動(dòng)態(tài)無偏差地觀察細(xì)胞的變化路徑。
彭廣敦和他的團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),此前單細(xì)胞分析方法會(huì)丟失細(xì)胞在體內(nèi)原有的位置信息,“鋪陳藍(lán)圖這個(gè)時(shí)期的胚胎直徑只有300微米,比一根頭發(fā)絲還細(xì),要結(jié)合新的更精密的技術(shù)方法組合分析。”
在經(jīng)歷反復(fù)搭建、嘗試新的技術(shù)體系之后,2019年,彭廣敦課題組聯(lián)合其他課題組共同繪制了細(xì)胞成長(zhǎng)軌跡三維立體圖,發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊上。
這項(xiàng)研究首次構(gòu)建了小鼠早期胚胎著床后發(fā)育時(shí)期高分辨率時(shí)空轉(zhuǎn)錄組圖譜,獲得了超2萬個(gè)基因從時(shí)間和空間上的表達(dá)模式;首次從分子層面揭示了內(nèi)胚層譜系的新來源,為理解胚層譜系建立及多能干細(xì)胞的命運(yùn)調(diào)控機(jī)制,提供了翔實(shí)的數(shù)據(jù),也為基于干細(xì)胞的再生醫(yī)學(xué)研究提供了全新思路。
“做科研最快樂的地方,是取得一點(diǎn)進(jìn)步,就很有獲得感。”彭廣敦說。目前,這項(xiàng)技術(shù)已成功應(yīng)用于小鼠大腦發(fā)育、肝臟腫瘤學(xué)等研究中,能夠還原生理、病理狀態(tài)下組織和器官層面重要的分子動(dòng)態(tài)特征。
科研是長(zhǎng)期的事業(yè),張弛有度才能持久
彭廣敦的科研之路并非一帆風(fēng)順,“每往前走一步,往往會(huì)有更多問題。”彭廣敦說。
回憶起剛開始帶團(tuán)隊(duì)做科研的經(jīng)歷,彭廣敦坦言遇到過不少坎,“團(tuán)隊(duì)一開始沒有知名度,招學(xué)生都難,只能四處推銷自己。”團(tuán)隊(duì)早期招來的學(xué)生,學(xué)科背景跨度比較大,數(shù)學(xué)、工程、人工智能、生物等專業(yè)都有。每次開組會(huì),彭廣敦會(huì)花更多時(shí)間去講解實(shí)驗(yàn)的意義和進(jìn)展,讓大家更充分地投入研究,激發(fā)持續(xù)探索的動(dòng)力。
科研創(chuàng)新需要跨學(xué)科的人才。漸漸地,彭廣敦發(fā)現(xiàn)多學(xué)科的團(tuán)隊(duì)常常帶來意外收獲。成員間的互相討論,經(jīng)常碰撞出思維的火花,“大家相互啟發(fā)、打氣,感覺自己并不孤單,充滿干勁。”在他看來,向他人學(xué)習(xí)有助于保持清醒,不斷突破已有的認(rèn)知框架,追尋新的發(fā)現(xiàn)。
細(xì)胞成長(zhǎng)軌跡三維立體圖的研究成果發(fā)表后,彭廣敦的壓力更大了。他發(fā)現(xiàn),近兩年,國際上相關(guān)領(lǐng)域的研究逐漸增多,有的團(tuán)隊(duì)在人員、設(shè)備、技術(shù)上都很有優(yōu)勢(shì)。“近些年,國內(nèi)基礎(chǔ)研究的創(chuàng)新氛圍愈發(fā)濃厚,鼓勵(lì)嘗試、允許試錯(cuò)。”彭廣敦說:“但時(shí)間、資源有限,如果長(zhǎng)期摸索不到正確的方向,就面臨著錯(cuò)過機(jī)會(huì)的風(fēng)險(xiǎn)。”
如何排解科研的緊迫感帶來的壓力?出生于文藝家庭的彭廣敦在工作之余,常從音樂、書籍中得到心靈的放松。交響樂、科幻小說中的詞語,也常常變成他在研究中形象生動(dòng)的比喻,啟發(fā)他從新角度看待科研。
“科研是長(zhǎng)期的事業(yè),張弛有度才能持久。保持好的心態(tài),才能更好地做科研。”未來,彭廣敦與團(tuán)隊(duì)希望在干細(xì)胞時(shí)空譜系研究上繼續(xù)取得突破。
(原載于《人民日?qǐng)?bào)》 2021-04-26 12版)
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